１．Googleの検索サイトに行きNCBIと打ち込んでみましょう。
２．最初に出てきたNCBI HomePageに行ってみましょう。
３．右側のHot Spotsにある Human genome resourcesをクリックしよう。
４．左に人の染色体が22プラスXYと並んでいます。１番染色体をクリックしよう。
５．左に染色体の模式図，右には対応する場所にいろんな遺伝子が並んでいます。
６．ＳymbolのPRAMEF1をクリックしてみよう。
７．Geneというデータベースにリンクしました。PRAMEF1という遺伝子の染色体の位置，遺伝子構造（エクソンーイントロン），判明していれば遺伝子の機能，mRNAの構造などが示されています。
８．一番下のAdditional linkというところにあるUniＧenのHs.454859をクリックしてみよう。
９．このデータベースはホモローグの存在の有無や，組織・発生ステージでの発現のデータを示しています。
１０．ためしにGENE EXPRESSIONのExpression Profileをクリックしてみてください。脳と精巣で発現しているらしいと言う事がわかりました。どうですか？ すごいでしょう。デスクワークで何でも知ったような気持ちになりますね。でもそれは錯覚です。これらデータを要領良く使って何を明らかにするかと言うことが重要なのです。我々の頭やセンスが問われるのです。でも素晴らしいでしょ。
次に核酸の配列からホモロジー検索を行なってみましょう。
試しに以下の配列を使ってみましょう。
XT100C03: Xenopus MyoD
NCBI Blastn:核酸対核酸
NCBI Blastx : 核酸（翻訳する）対蛋白質 でホモロジーサーチを行ないます。Xenopus MyoDの配列をコピーしてください。 NCBI Blast siteに行きましょう。出てきた画面の
Basic BLAST
の欄の
nucleotide blast
をクリックしてください。Search画面に配列をペーストしてください。databaseはothersに、nucleotide collection (nr/nt)を選んだところで、Blast!をクリックしてください。画面が変わるのでFormat! をクリックしてください。結果が表示されます。ずらずらと赤いバーが見えます。これはヒットした事を示しています。↓にスクロールしてみてください。
gi|64906|emb|X16106.1|XLMYODMR Xenopus laevis myoD gene for myc- という列がまず見えます。この列の右側にU, E, Gと表示されています。
UはUnigene
にリンクしています。Unigeneでは先程やった事と同じ事をすれば発現も見る事が出来ます。
Gと表示されたところをクリックすると
Ｇeneのデータベース
にリンクします。Bibliographyの欄にPubMed linksという文字があるのでそこをクリックしてみましょう。いくつか論文が出てきました。こんな感じで知りたい遺伝子に関する論文を検索できます。
あるいはＰubMedにキーワードをを打ち込む事です。キーワードがMyoDだけではヒットする文献が多すぎるので MyoD AND Xenopus AND Muscle などと入れて検索してみてください。